Resumen

Análisis transcriptómicos previos revelaron una firma de 393 transcritos (PTBsig), dominada por genes inducibles por interferón, en sangre total de pacientes con tuberculosis pulmonar (PTB). Las comparaciones con un conjunto limitado de genes inducidos por interferón entre monocitos, linfocitos T CD4, linfocitos T CD8 y neutrófilos separados indicaron que la firma se debe a cambios en los neutrófilos, el tipo celular abrumadoramente predominante. Ampliando el análisis a la totalidad de los 393 transcritos de PTBsig y cambiando las proporciones celulares entre monocitos, linfocitos T CD4, linfocitos T CD8 y neutrófilos separados, creamos PTBsig putativas para sangre completa (pPTBsig) en las que predominaban los linfocitos T CD4 o CD8 o los monocitos o en las que las proporciones celulares no cambiaban. A continuación, estas firmas putativas se comparan con las PTBsig reales notificadas. Demostramos que, debido a su predominio en la sangre periférica y a sus mayores respuestas transcripcionales, los neutrófilos eran de hecho casi exclusivamente responsables de la PTBsig. Advertimos que la importancia funcional de los cambios en otros tipos celulares podría pasar desapercibida en los análisis del transcriptoma basados en sangre total.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:Células T CD8, células T CD4, sangre total, PTBsig, neutrófilos, proporciones celulares, análisis transcriptómico previo, respuestas transcripcionales mayores, otros tipos celulares, tipo celular predominante
• Keywords:CD8+ T cells, CD4+ T cells, whole blood, PTBsig, neutrophils, cell proportions, Previous transcriptomic analysis, larger transcriptional responses, other cell types, predominant cell type