El ADN repetitivo -específicamente, los elementos transponibles (ET)- es una fracción genómica predominante en los cereales que subyace a una amplia reorganización del genoma y a la diversificación intraespecífica en estado silvestre. Aunque se han acumulado grandes cantidades de datos, el efecto de los TEs sobre la arquitectura y el funcionamiento del genoma no se conoce del todo. Aquí se abordó la organización del genoma de la planta mediante la clonación y secuenciación de fragmentos de TE de diferentes tipos, que componen la mayor parte del genoma de Aegilops speltoides. Se analizaron citogenéticamente genotipos individuales utilizando los fragmentos TE clonados como sondas de ADN para hibridación fluorescente in situ (FISH). Las secuencias TE obtenidas de las superfamilias Ty1-copia, Ty3-gypsy, LINE y CACTA mostraron el parentesco del genoma de Ae. speltoides con la tribu Triticeae y similitudes con especies evolutivamente distantes. Un número significativo de clones consistía en fragmentos intercalados de TEs de varios tipos, en los que predominaban las secuencias Fátima (Ty3-gypsy). A nivel cromosómico, diferentes clones de TE demostraron un patrón específico de secuencias, enfatizando el efecto de la fracción de TE en la arquitectura del genoma de Ae. speltoides y la diversificación intraespecífica. En conjunto, los datos obtenidos ponen de relieve la organización y el patrón actuales específicos de la especie de la fracción de elementos móviles y apuntan a antiguos acontecimientos evolutivos en el genoma de Ae. speltoides.
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