Resumen

La medicina tradicional china (MTC), originaria de la antigua China, se ha practicado durante miles de años para tratar diversos síntomas y enfermedades. Sin embargo, los mecanismos moleculares de la MTC en el tratamiento de estas enfermedades siguen siendo desconocidos. En este estudio, empleamos un enfoque basado en la farmacología de sistemas para conectar las enfermedades GWAS con la MTC para el potencial reposicionamiento de fármacos. Estudiamos 102 componentes de la MTC y sus genes diana mediante el análisis de experimentos de expresión génica de microarrays. Construimos redes enfermedad-gen a partir de 2558 estudios GWAS. Aplicamos un enfoque de farmacología de sistemas para priorizar los genes diana de enfermedades. Utilizando este enfoque bioinformático, analizamos 14.713 pares enfermedad-GCM-gen diana de GWAS e identificamos 115 pares enfermedad-gen con un valor q < 0,2. Validamos varios de estos genes diana de GWAS. Validamos varios de estos pares de genes diana enfermedad-MTC del GWAS con pruebas bibliográficas, lo que demuestra que este enfoque computacional podría revelar nuevas indicaciones para la MTC. También desarrollamos la aplicación web TCM-Disease para facilitar los esfuerzos de reutilización de fármacos de la medicina tradicional china. La farmacología de sistemas es un enfoque prometedor para conectar las enfermedades GWAS con la MTC para la potencial reutilización y reposicionamiento de fármacos. Los enfoques computacionales descritos en este estudio podrían ampliarse fácilmente a otros análisis de redes de genes de enfermedades.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Biogénesis Genética vegetal Genómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Biogenesis Plant genetics Genomics
• Palabras claves:MTC, pares de genes diana, enfermedad, enfermedad GWAS, enfermedades GWAS, fármaco potencial, genes diana, experimentos de expresión génica con microarrays, fármaco de medicina tradicional china, aplicación web de enfermedades
• Keywords:TCM, target gene pairs, disease, GWAS disease, GWAS diseases, potential drug, target genes, microarray gene expression experiments, traditional Chinese medicine drug, Disease web application