Resumen

A pesar de que la cabra es uno de los mejores sistemas no modelo para el estudio del crecimiento de las vellosidades y la biología del pelo, los recursos genéticos disponibles asociados a la piel o los folículos pilosos son limitados. En el presente estudio, utilizando la tecnología de secuenciación Illumina/Solexa, hemos ensamblado de novo 130 millones de lecturas mRNA-Seq en un total de 49.115 contigs. La búsqueda en bases de datos públicas reveló que alrededor del 45% del total de contigs pueden ser anotados como proteínas conocidas, lo que indica que algunos de los contigs ensamblados pueden tener funciones previamente no caracterizadas. La clasificación funcional mediante KOG y GO mostró que las actividades asociadas al metabolismo son predominantes en la piel de cabra durante la fase anágena. También se crearon muchas vías de señalización a partir del mapeo de los contigs ensamblados en la base de datos de vías KEGG, algunas de las cuales han demostrado previamente tener diversas funciones en la formación del folículo piloso y del tallo piloso. Además, el perfil de expresión génica de tres tipos de piel identificó ~6.300 contigs derivados de transcripciones que se expresan de forma diferencial. Estos genes se enriquecieron principalmente en el grupo funcional asociado al ciclo y la división celular. El amplio catálogo de contigs, así como los genes que se expresaban de forma diferencial en los distintos tipos de piel, proporcionan valiosos candidatos para una mayor caracterización de las funciones génicas.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genómica Polimorfismo genético Proteómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Genomics Genetic polymorphism Proteomics Computational biology
• Palabras claves:contigs, base de datos de vías KEGG, mejores sistemas no modelo, diferentes tipos de piel, perfiles de expresión génica, formación del tallo piloso, gran catálogo de contigs, recursos génicos limitados, estudios de crecimiento de vellosidades, genes
• Keywords:contigs, KEGG pathway database, best nonmodel systems, different skin types, gene expression profiling, hair shaft formation, large contig catalogue, limited gene resources, villus growth studies, genes