Las infecciones respiratorias agudas graves (IRAG) son un problema de salud pública frecuente en niños y se asocian a una importante tasa de morbilidad y mortalidad en todo el mundo. Aunque las IRAG están causadas principalmente por virus, siguen siendo una de las causas del uso excesivo de antibióticos. El uso de métodos moleculares, especialmente la PCR multiplex en tiempo real, ha permitido detectar una amplia gama de virus respiratorios y sus subtipos, así como algunas bacterias atípicas. El objetivo de este estudio fue investigar la epidemiología de los patógenos respiratorios detectados en niños ingresados con SARI y destacar el papel de la PCR multiplex en tiempo real en el diagnóstico rápido de SARI virales y bacterianas. Este trabajo es un estudio observacional descriptivo de enero de 2018 a diciembre de 2019 que incluye secreciones nasofaríngeas recogidas de 534 niños hospitalizados en el departamento de pediatría. La detección de virus respiratorios y bacterias se realizó mediante el Panel Respiratorio FilmArray®. Un total de 387 (72,5%) niños resultaron positivos para al menos un patógeno respiratorio, y el 23,3% de ellos estaban coinfectados por más de un patógeno. La etiología viral se detectó en el 91,2% (n = 340). Los virus detectados con mayor frecuencia fueron HRV (n = 201) y RSV (n = 124), seguidos de PIV (n = 35) influenza A (n = 29) y metapneumovirus humano (n = 27). Se encontraron bacterias en el 8,8% (n = 47), y la Bordetella pertussis fue la más detectada. El virus respiratorio sincitial y la Bordetella pertussis fueron significativamente mayores en los lactantes menores de 6 meses. La detección del VRS y la gripe A presentó un pic en invierno, y la del VMPH fue estadísticamente significativa en primavera (p<0,01). Este estudio describió la epidemiología de los patógenos respiratorios implicados en las infecciones respiratorias graves en niños, que se vieron afectados por varios factores, como la estación del año y el grupo de edad. También puso de relieve la importancia de la PCR multiplex para confirmar el origen vírico, evitando así la prescripción irracional de antibióticos en entornos pediátricos.
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