Resumen

La proteína de replicación A (RPA) desempeña un papel esencial en la replicación del ADN al unirse y desplegar estructuras no canónicas de ADN monocatenario (ssADN). De los seis dominios de unión a ssDNA de RPA (etiquetados A-F), RPA-CDE se une selectivamente a una secuencia formadora de cuadruplex G (5′-TAGGGGAAGGGTTGGGAGTGGGGTT-3′ denominada Gq23). En K , Gq23 forma una conformación mixta paralela/antiparalela, y en Na Gq23 tiene una conformación antiparalela menos estable (TM disminuida en ~20∘C). Gq23 es intramolecular y la RMN 1D confirma una estructura G-cuadruplex estable en K . El RPA completo y el núcleo RPA-CDE pueden unirse y desplegar la forma Na de Gq23 de forma muy eficiente, pero no se observa un despliegue completo con la forma K. Los estudios con ligandos G-quadruplex indican que TMPyP4 tiene un efecto de estabilización térmica sobre Gq23 en K , e inhibe el despliegue completo por RPA y RPA-CDE-core. En general, estos datos indican que los cuadruplexos G presentan un problema único para el despliegue de la RPA y que los ligandos, como el TMPyP4, podrían obstaculizar la replicación del ADN bloqueando el despliegue de la RPA.

• Materias:Ingeniería genética Ácido desoxirribonucleico (ADN) Ácido ribonucleico (ARN) Pliegue de Proteína Genómica
• Subjects:Genetic engineering Deoxyribonucleic acid (DNA) Ribonucleic acid (RNA) Protein Folding Genomics
• Palabras claves:rpa, gq23, cde, replicación del adn, desdoblamiento completo, proteína de replicación a, efecto de estabilización térmica, tmpyp4, core, 1d nmr
• Keywords:rpa, gq23, cde, dna replication, complete unfolding, replication protein a, thermal stabilization effect, tmpyp4, core, 1d nmr