Resumen

La vía MAPK/ERK es un importante sistema de transducción de señales que regula muchos procesos celulares fundamentales, como el control del crecimiento y la muerte celular. Como resultado de estas funciones, tiene una importancia crucial tanto en el cáncer como en los procesos normales de desarrollo. Por lo tanto, se ha estudiado intensamente, lo que ha dado lugar a una gran cantidad de conocimientos sobre su activación. También está bien documentado que la cinética de activación de la vía es crucial para determinar la naturaleza de la respuesta biológica. Sin embargo, aunque los pasos bioquímicos individuales están bien caracterizados, sigue siendo difícil predecir o incluso comprender cómo funciona la cinética de activación. El objetivo de este trabajo es estimar las constantes de velocidad estocásticas de la dinámica de la red MAPK/ERK. En consecuencia, adoptando un enfoque bayesiano, combinamos el conocimiento biológico cualitativo subyacente en varios modelos dinámicos competidores a través de conjuntos de cuasireacciones y estimamos las constantes de velocidad estocástica de estas reacciones. Comparando las estimaciones resultantes mediante los criterios BIC y DIC, elegimos un modelo biológico que incluye la degradación de EGFR-cascada Raf-MEK-ERK sin la participación de RKIPs.

• Materias:Análisis Matemático Álgebra Ingeniería Matemática aplicada Lógica matemática
• Subjects:Mathematical Analysis Algebra Engineering Applied Mathematics Mathematical logic
• Palabras claves:constantes de velocidad estocásticas, cinética de activación, principal sistema de transducción de señales, muchos procesos celulares fundamentales, conocimiento biológico cualitativo subyacente, dinámica de redes erk, pasos bioquímicos individuales, procesos normales de desarrollo, mapk, enfoque bayesiano
• Keywords:stochastic rate constants, activation kinetics, major signal transduction system, many fundamental cellular processes, underlying qualitative biological knowledge, erk network dynamics, individual biochemical steps, normal developmental processes, mapk, bayesian approach