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Artículo

In silico co-factor balance estimation using constraint-based modelling informs metabolic engineering in Escherichia coliEstimación in silico del equilibrio de cofactores en ingeniería metabólica de Escherichia coli a través de modelos basados en restricciones

Resumen

En el creciente campo de la ingeniería metabólica donde las células son utilizadas como fábricas para la síntesis de compuestos industriales, es esencial considerar la habilidad del metabolismo nativo de las células para adaptarse a las demandas de las vías sintéticas, ya que estas vías alteran la homeostasis de la energía celular y el metabolismo de electrones. A partir de la descomposición del sustrato, los microorganismos activan y reducen cofactores clave como ATP y NAD(P)H, que posteriormente deben hidrolizarse y oxidarse, respectivamente, para restablecer el equilibrio celular. El propósito de este trabajo consiste en implementar un protocolo de análisis de equilibrio de cofactores (CBA) para cuantificar el equilibrio de cofactores de los diseños de ingeniería metabólica utilizando técnicas de modelado basadas en restricciones bien conocidas, como Flux Balance Analysis (FBA), parsimoniosa FBA y MOMA.

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