La introducción de los conceptos de red compleja en el estudio de los sistemas de transporte ha supuesto un cambio de paradigma y ha permitido entender distintos fenómenos del transporte como el resultado emergente de las interacciones entre los elementos que los componen. A pesar de varios logros notables, existen escollos que socavan nuestra comprensión de las características topológicas de los sistemas de transporte. En este estudio analizamos cuatro de los más comunes, relacionados específicamente con la evaluación de la escalabilidad de las redes, la interpretación y comparación de métricas topológicas, la definición de un ranking de nodos y el análisis de la resiliencia frente a fallos aleatorios y ataques dirigidos. Para cada tema presentamos el problema desde una perspectiva tanto teórica como operativa, para después revisar cómo se ha abordado en la bibliografía y, por último, proponer un conjunto de soluciones. Además, utilizamos seis redes de transporte del mundo real como casos de estudio y discutimos las implicaciones de estos cuatro escollos en su análisis. Presentamos algunas líneas de trabajo futuras que se derivan de estos escollos y que permitirán una comprensión más profunda de los sistemas de transporte desde la perspectiva de las redes complejas.
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