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A Comparative Study on Phenotypic versus ITS-Based Molecular Identification of Dermatophytes Isolated in Dakar, SenegalEstudio comparativo entre la identificación fenotípica y la identificación molecular basada en ITS de dermatofitos aislados en Dakar (Senegal)

Resumen

Clásicamente, los dermatofitos se identifican por métodos fenotípicos, aunque estos métodos, a veces, siguen siendo difíciles o inciertos. Por otro lado, el análisis de la secuencia de nucleótidos de los espaciadores transcritos internos (ITS) del ADNr ha demostrado ser un método útil para la identificación de dermatofitos. El objetivo de este estudio era comparar el método fenotípico con la secuenciación del ADN de las regiones ITS para la identificación de especies de dermatofitos aisladas en Dakar (Senegal). Se aisló una colección de treinta y dos cepas de dermatofitos de pacientes con dermatofitosis. La identificación micológica reveló la presencia de Trichophyton soudanense (n = 13), T. interdigitale (n = 10), Microsporum audouinii (n = 5) y una cepa de cada una de las siguientes especies: T. rubrum, T. mentagrophytes y M. canis y una cepa no identificada. Para la comparación, se aplicaron la PCR basada en ITS y la secuenciación del ADN para la identificación de los dermatofitos aislados. Las secuencias ITS mostraron, en el análisis de búsqueda BLAST, un 99-100% de similitud. La identificación de los dermatofitos aislados por métodos convencionales se confirmó mediante secuenciación del ADN de las regiones ITS en el 84% de los casos. Las discrepancias se referían sobre todo a T. rubrum identificado erróneamente como T. interdigitale. La secuenciación por PCR proporcionó una herramienta excelente para identificar cepas de dermatofitos que no presentan características morfológicas típicas. También permitió identificar correctamente una cepa atípica de M. audouinii responsable de un micetoma del cuero cabelludo.

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Información del documento

  • Titulo:A Comparative Study on Phenotypic versus ITS-Based Molecular Identification of Dermatophytes Isolated in Dakar, Senegal
  • Autor:Khadim, Diongue; Ludivine, Bréchard; Mamadou Alpha, Diallo; Mame Cheikh, Seck; Mouhamadou, Ndiaye; Aida Sadikh, Badiane; Stéphane, Ranque; Daouda, Ndiaye
  • Tipo:Artículo
  • Año:2019
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi
  • Materias:Microbiología de alimentos Bacteriología Propiedades farmacológicas Micología
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