Se utilizó un método metabolómico basado en la resonancia magnética nuclear (RMN) para identificar metabolitos diferenciales de extractos de metanol obtenidos de seis partes de Peganum harmala L. (P. harmala), a saber, la raíz, el tallo, la hoja, la flor, el tegumento y la semilla. Se combinaron dos métodos de análisis estadístico multivariante, el análisis de componentes principales (ACP) y el análisis discriminante de mínimos cuadrados parciales (AD-PLS), para distinguir claramente entre las muestras de P. harmala de las seis partes diferentes. Se seleccionaron once componentes diferenciales mediante el diagrama de carga PLS-DA y se calcularon los contenidos relativos mediante el análisis univariante de la varianza. Los resultados quimiométricos mostraron diferencias significativas en los metabolitos de las distintas partes de P. harmala. Las semillas contenían grandes cantidades de harmalina, harmina y vasicina en comparación con otros órganos. Los contenidos de ácido acético, prolina, lisina y sacarosa de las raíces eran significativamente superiores a los de las otras partes. En el tegumento, los contenidos de vasicina, asparagina, colina y 4-hidroxiisoleucina eran claramente dominantes. Los datos obtenidos revelaron las características de distribución de los metabolomas de las diferentes partes de P. harmala y proporcionaron conocimientos fundamentales para el desarrollo racional de sus partes medicinales.
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