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Artículo

Impact of -Turn Sequence on -Hairpin Dynamics Studied with Infrared-Detected Temperature JumpImpacto de la secuencia de giro en la dinámica de la horquilla estudiada con saltos de temperatura detectados por infrarrojos

Resumen

Se estudiaron las dinámicas de plegamiento para la pérdida de estructura - y la ganancia de estructura desordenada en un péptido modelo -hairpin basado en el péptido zipper de triptófano de Cochrans Trpzip2, pero con una secuencia de giro Thr-Gly (TG) alterada, es decir, SWTWEKWTWK, utilizando cinética de salto de temperatura inducido por láser (T-jump) con detección IR. Como se ha demostrado previamente, la secuencia de giro TG reduce la estabilidad termodinámica del -hairpin en comparación con la secuencia de Asn-Gly utilizada en Trpzip2 (TZ2-NG). En este estudio, encontramos que el giro TG ralentiza la dinámica de relajación general en comparación con TZ2-NG, que se estudiaron a temperaturas más altas donde las constantes de tiempo muestran poca diferencia entre la relajación del -hélice y la conformación desordenada. Estas constantes de tiempo se vuelven equivalentes a temperaturas más

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