La unión y cambio conformacional del ácido all-trans retinoico (ATRA) con la peptidil prolyl isomerasa Pin1 fueron investigados sistemáticamente mediante técnicas espectroscópicas y computacionales bajo condiciones fisiológicas experimentales optimizadas. La fluorescencia intrínseca de Pin1 fue apagada a través de un mecanismo de apagado estático en presencia de ATRA con constantes de unión del orden de 10mol/L. Los parámetros termodinámicos (=15.76kJ/mol y =158.36J/molK a 293K) y los resultados computacionales ilustraron que las interacciones hidrofóbicas jugaron un papel significativo en el proceso de unión de ATRA a Pin1, pero las fuerzas electrostáticas, débiles fuerzas de van der Waals y enlaces de hidrógeno no pueden ser ignorados. La dicroísmo circular, los espectros de fluorescencia y las simulaciones computacionales revelaron que ATRA interactuaba con los residuos Lys63 y Arg69 de Pin1 para afectar sus cambios conformacionales. La simulación dinámica molecular, el análisis de componentes principales y el paisaje de energía libre monitorearon las características conformacionales dinámicas de la unión de ATRA a Pin1. En resumen, la presente investigación podría proporcionar una referencia para el desarrollo y diseño de fármacos de ácido retinoico que inhiban la actividad de Pin1.
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