Resumen

La expresión génica está regulada por factores de transcripción, que intervienen en muchos procesos importantes del desarrollo. Las proteínas de unión al promotor SQUAMOSA (SBP) desempeñan diversas funciones reguladoras en el desarrollo de hojas, flores y frutos, la arquitectura de la planta y la esporogénesis. Se identificaron 16 genes SBP en la piña y se dividieron en cuatro grupos en base al análisis filogenético. Se identificaron cinco paralogos en la piña para los genes SBP con una relación Ka/Ks que variaba de 0,20 para AcSBP14 y AcSBP15 a 0,36 para AcSBP6 y AcSBP16, respectivamente. 16 genes SBP se localizaron en 12 cromosomas de los 25 cromosomas de la piña con estructuras de secuencias de proteínas altamente conservadas. Los puntos isoiónicos de SBP oscilaron entre 6,05 y 9,57, mientras que el peso molecular varió entre 22,7 y 121,9 kD. Los perfiles de expresión de los genes SBP revelaron que AcSBP7 y AcSBP15 (hoja), AcSBP13, AcSBP12, AcSBP8, AcSBP16, AcSBP9 y AcSBP11 (sépalo), AcSBP6, AcSBP4 y AcSBP10 (estambre), AcSBP14, AcSBP1 y AcSBP5 (fruto), mientras que el resto de genes mostraron una baja expresión en los tejidos estudiados. Cuatro genes, AcSBP11, AcSBP6, AcSBP4 y AcSBP12, se expresaron en mayor medida a 4°C, mientras que AcSBP16 se incrementó a 45°C. La RNA-Seq se validó mediante qRT-PCR para algunos genes. El estrés salino indujo la expresión de dos genes, a saber, AcSBP7 y AcSBP14, mientras que en el estrés por sequía, AcSBP12 y AcSBP15 fueron altamente expresados. Nuestro estudio sienta las bases para futuros estudios de función y expresión génica de los genes SBP en piña.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:Genes SBP, genes, AcSBP12, AcSBP15, AcSBP6, piña, estructuras de secuencias proteicas conservadas, muchos procesos de desarrollo significativos, función adicional de los genes, kD. Perfiles de expresión
• Keywords:SBP genes, genes, AcSBP12, AcSBP15, AcSBP6, pineapple, conserved protein sequence structures, many significant developmental processes, further gene function, kD. Expression profiles