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RNA-Based Assessment of Diversity and Composition of Active Archaeal Communities in the German BightEvaluación basada en el ARN de la diversidad y composición de las comunidades arqueas activas en la bahía alemana

Resumen

Las arqueas desempeñan un papel importante en diversos ciclos biogeoquímicos. Son conocidos extremófilos que habitan en entornos como las fuentes termales o los respiraderos hidrotermales. Estudios recientes han revelado una importante abundancia de Archaea en entornos moderados, por ejemplo, en aguas marinas templadas. Sin embargo, se desconoce en gran medida la composición y la función ecosistémica de estas comunidades arqueas marinas. Para evaluar la diversidad y la composición de las comunidades arqueas activas en la bahía alemana, se tomaron siete muestras de agua marina y se estudiaron mediante un análisis basado en el ARN del ribosoma 16S rRNA. Para ello, se extrajo el ARN total de las muestras y se convirtió en ADNc. Las estructuras de las comunidades de arqueas se investigaron mediante el análisis basado en la pirosecuenciación de los amplicones de ARNr 16S generados a partir del ADNc. Hasta donde sabemos, este es el primer estudio que combina la secuenciación de nueva generación y la metatranscriptómica para estudiar las comunidades de arqueas en hábitats marinos. El conjunto de datos derivados de la pirosecuenciación comprendía 62.045 secuencias de ARNr 16S de arqueas. Identificamos a las Halobacterias como el grupo arqueológico predominante en todas las muestras, con una mayor abundancia en las floraciones de algas. Las Thermoplasmatales (Euryarchaeota) y el Grupo Marino I (Thaumarchaeota) se identificaron en menor abundancia. Se indica que los patrones de la comunidad de arqueas estaban influidos por las condiciones ambientales.

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Información del documento

  • Titulo:RNA-Based Assessment of Diversity and Composition of Active Archaeal Communities in the German Bight
  • Autor:Bernd, Wemheuer; Franziska, Wemheuer; Rolf, Daniel
  • Tipo:Artículo
  • Año:2012
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi Publishing Corporation
  • Materias:Bioquímica Ácido ribonucleico (ARN) Arqueas Biogénesis
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