Las arqueas desempeñan un papel importante en diversos ciclos biogeoquímicos. Son conocidos extremófilos que habitan en entornos como las fuentes termales o los respiraderos hidrotermales. Estudios recientes han revelado una importante abundancia de Archaea en entornos moderados, por ejemplo, en aguas marinas templadas. Sin embargo, se desconoce en gran medida la composición y la función ecosistémica de estas comunidades arqueas marinas. Para evaluar la diversidad y la composición de las comunidades arqueas activas en la bahía alemana, se tomaron siete muestras de agua marina y se estudiaron mediante un análisis basado en el ARN del ribosoma 16S rRNA. Para ello, se extrajo el ARN total de las muestras y se convirtió en ADNc. Las estructuras de las comunidades de arqueas se investigaron mediante el análisis basado en la pirosecuenciación de los amplicones de ARNr 16S generados a partir del ADNc. Hasta donde sabemos, este es el primer estudio que combina la secuenciación de nueva generación y la metatranscriptómica para estudiar las comunidades de arqueas en hábitats marinos. El conjunto de datos derivados de la pirosecuenciación comprendía 62.045 secuencias de ARNr 16S de arqueas. Identificamos a las Halobacterias como el grupo arqueológico predominante en todas las muestras, con una mayor abundancia en las floraciones de algas. Las Thermoplasmatales (Euryarchaeota) y el Grupo Marino I (Thaumarchaeota) se identificaron en menor abundancia. Se indica que los patrones de la comunidad de arqueas estaban influidos por las condiciones ambientales.
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