Resumen

Para obtener información sobre procesos biológicos, por lo general, los datos de escala genómica son superpuestos en redes bioquímicas. Sin embargo, muchas redes no tienen una relación uno a uno con respecto a los genes debido a la existencia de isoenzimas y complejos de proteínas. En este sentido, es necesario tomar decisiones sobre cómo integrar los niveles de expresión génica mediante reglas de reacción gen-proteína; cuál enfoque debe utilizarse para la selección de umbrales en los datos de expresión para considerar el gen asociado como "activo" y cuál es el orden en que estos pasos se imponen. En este sentido, el presente trabajo presenta una comparación de 20 combinaciones de decisiones utilizando un conjunto de datos transcriptómicos en 32 tejidos. Para determinar las decisiones más apropiadas, se evaluó el impacto de estas decisiones en la adquisición de listas de reacciones activas específicas de tejido que recapitulan grupos de tejidos de órganos y sistemas.

• Materias:Tecnología médica Investigación médica Investigación biológica Investigación Ingeniería genética Ingeniería biomédica Biotecnología Bioingeniería
• Subjects:Medical technology Medical research Biological research Scientific research Genetic engineering Biomedical engineering Biotechnology Bioengineering
• Palabras claves:Procesando; La expresión génica; Mapeo de genes; Enzimas; Análisis del transcriptoma; Redes genéticas; Redes metabólicas; Metabolismo de proteínas
• Keywords:Processing; Gene expression; Gene mapping; Enzymes; Transcriptome analysis; Genetic networks; Metabolic networks; Protein metabolism