Resumen

Mediante simulación de dinámica molecular, estudiamos la evaporación de moléculas de agua de la ubiquitina parcialmente solvatada. Se determinan las velocidades de evaporación y enfriamiento para una molécula a la temperatura inicial de 300 K. Se encuentra que la velocidad de enfriamiento es de alrededor de 3 K/ns, y disminuye con la temperatura del agua en el curso de la evaporación. Los cambios de conformación se monitorizan estudiando una variedad de estructuras intermedias de ubiquitina parcialmente solvatada. Encontramos que la ubiquitina se encoge con la disminución de la cáscara de hidratación y expone más de su superficie hidrofílica al entorno.

• Materias:Células Enzimas Proteínas Microorganismos patógenos endopeptidasas
• Subjects:Cells Enzymes Proteins Pathogenic microorganisms endopeptidases
• Palabras claves:estructura de ubiquitina solvatada, evaporación del agua, simulación dinámica molecular, superficie hidrofílica, variedad de intermedios, cambio de conformación, temperatura del agua, evaporación, velocidad, contracción de ubiquitina
• Keywords:solvated ubiquitin structure, evaporation of water, molecular dynamic simulation, hydrophilic surface area, variety of intermediate, conformation change, water temperature, evaporation, rate, ubiquitin shrink