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Artículo

Evidence for Directed Evolution of Larger Size Motif in GenomeEvidencia de la Evolución Dirigida de un Motivo de Mayor Tamaño en el Genoma

Resumen

El control de la transcripción de la expresión génica depende de una variedad de interacciones mediadas por la región promotora central, proteínas de unión al ADN específicas de secuencia y sus elementos promotores cognados. El grupo prominente de elementos activos en plantas contiene un núcleo ACGT. Se ha demostrado que el elemento con este núcleo está involucrado en la respuesta al ácido abscísico, ácido salicílico y luz. En este estudio, se llevó a cabo una comparación a nivel genómico de la frecuencia de ocurrencia de dos elementos ACGT sin espaciadores, así como aquellos separados por espaciadores de diferente longitud. En el primer paso, la frecuencia de ocurrencia de las secuencias de elementos ACGT en todo el genoma fue determinada utilizando la herramienta BLAST. En otro enfoque, la secuencia del espaciador fue aleatorizada antes de realizar la consulta. Como se esperaba, la secuencia ACGTACGT tuvo la máxima ocurrencia en el genoma. A medida que aumentamos la

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