Resumen

Se ha descubierto que los helechos epífitos florecen después de que las angiospermas dominen las comunidades forestales y desempeñan un papel importante en las copas de los árboles de los bosques tropicales. ¿Cómo se adaptan los helechos epífitos a los doseles de los bosques tropicales? En la actualidad, sabemos poco sobre el mecanismo molecular que subyace a esta adaptación. Asplenium nidus es un helecho epífito muy conocido que está estrechamente relacionado con la especie terrestre Asplenium komarovii. Se realizaron análisis de RNA-seq y transcriptómicos comparativos para explorar las bases subyacentes de la adaptación de A. nidus a ambientes extremos. Se obtuvo un total de 44,04 y 44,57 Mb de lecturas limpias de A. nidus y A. komarovii, respectivamente, y se ensamblaron en 89.741 y 77.912 unigenes. La anotación funcional mostró que 52.305 (58,28% del total de genes de A. nidus) y 45.938 (58,96% del total de genes de A. komarovii) unigenes estaban anotados en bases de datos públicas. Se observó que los genes implicados en las respuestas al estrés y en la fotosíntesis habían sufrido una selección positiva en A. nidus. En comparación con A. komarovii, los factores de transcripción relacionados con la respuesta al estrés, el desarrollo de la hoja y el desarrollo de la raíz se encontraron considerablemente expandidos en A. nidus, especialmente en el subclado ANR1 de genes de la familia MADS-box que desempeñan funciones en el desarrollo de la raíz lateral. Este estudio mejora nuestra comprensión de la adaptación de A. nidus a hábitats epífitos mediante la formación de estrategias únicas.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:A. nidus, A. komarovii, adaptación, genes totales, especie terrestre Asplenium komarovii, hábitats de dosel de selva tropical, genes de la familia box, análisis transcriptómicos comparativos, desarrollo de raíces laterales, unigenes
• Keywords:A. nidus, A. komarovii, adaptation, total genes, terrestrial species Asplenium komarovii, tropical rainforest canopy habitats, box family genes, comparative transcriptomic analyses, lateral root development, unigenes