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Artículo

Selective Evolution of Ligands by Exponential Enrichment to Identify RNA Aptamers against Shiga ToxinsEvolución selectiva de ligandos mediante enriquecimiento exponencial para identificar aptámeros de ARN contra toxinas Shiga

Resumen

La infección por E. coli productora de toxina Shiga (Stx) provoca el síndrome urémico hemolítico (SUH), una de las principales causas de insuficiencia renal aguda en niños. De las dos toxinas antigénicamente distintas, Stx1 y Stx2, la Stx2 está más firmemente vinculada al desarrollo del SHU. En el presente estudio, se utilizó la evolución selectiva de ligandos por enriquecimiento exponencial (SELEX) en un intento de identificar aptámeros de ARN contra Stx1 y Stx2. Tras 5 rondas de selección, se obtuvo un enriquecimiento significativo del conjunto de aptámeros contra Stx2, pero no contra Stx1, utilizando una biblioteca de aptámeros de ARN que contenía 56 nucleótidos aleatorios (N56). La caracterización de las secuencias individuales de los aptámeros reveló que seis aptámeros de ARN únicos (mA/pC, mB/pA, mC, mD, pB y pD) reconocían a Stx2 en un ensayo de unión por filtro. Ninguno de estos aptámeros se unió a Stx1. Los aptámeros mA/pC, mB/pA, mC y mD, pero no pB y pD, bloquearon parcialmente la unión de Stx2 marcada con Alexa 488 a células HeLa en un ensayo de citometría de flujo. Sin embargo, ninguno de los aptámeros neutralizó la citotoxicidad mediada por Stx2 y la muerte de las células HeLa.

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