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Evolutionary Pattern of Asian HIV-1 Subtype B from 1990 to 2007: Analysis Based on Envelop ProteinPatrón evolutivo del subtipo B del VIH-1 asiático de 1990 a 2007: Análisis basado en la proteína de envoltura.

Resumen

El gen de envoltura del VIH-1 es un objetivo importante para el desarrollo de vacunas. Se ha demostrado que la proteína de envoltura y su bucle V3 son determinantes importantes de la patogenicidad del VIH-1. En este estudio, se determina el patrón evolutivo del subtipo B de VIH-1 más prevalente en Asia mediante el análisis de la proteína de envoltura y el dominio V3 basado en 40 secuencias seleccionadas al azar de VIH-1 de la base de datos (Los Álamos), divididas en cuatro grupos desde 1990 a 2007. La construcción de la filogenia de la proteína de envoltura utilizando MEGA 5 muestra el patrón de mutación activa, el aumento en los sitios potenciales de N-glicosilación que fueron predichos utilizando el software en línea SignalP-NN. Se utilizó la herramienta en línea Drawgram para el alineamiento de múltiples secuencias (MSA) de la región de envoltura y el bucle V3 del subtipo B de VIH

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