Chlamydia spp. son patógenos intracelulares obligados que se replican dentro de una vacuola denominada inclusión. Las clamidias modifican ampliamente la membrana de inclusión mediante la inserción de proteínas de membrana de inclusión clamidiales (Incs) que decoran la cara citosólica de la inclusión. Hemos evaluado el parentesco general y la filogenia de las Incs para identificar posibles tendencias evolutivas. A pesar del alto grado de conservación entre las Incs dentro de los serovares de C. trachomatis, el análisis filogenético mostró que algunas Incs se agrupan según agrupaciones clínicas, lo que sugiere que ciertas Incs pueden contribuir al tropismo tisular. Las predicciones bioinformáticas identificaron Incs en cinco especies de clamidias: 55 en C. trachomatis, 68 en C. felis, 92 en C. pneumoniae, 79 en C. caviae y 54 en C. muridarum. Se compararon los homólogos de Incs entre especies de clamidias y se identificaron 23 Incs centrales compartidos entre todas las especies. Se identificó una expansión genómica de Incs en C. pneumoniae, C. caviae y C. felis, pero no en C. trachomatis o C. muridarum.
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