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Exception to the Rule: Genomic Characterization of Naturally Occurring Unusual Vibrio cholerae Strains with a Single ChromosomeExcepción a la regla: Caracterización genómica de cepas inusuales de Vibrio cholerae de origen natural con un solo cromosoma

Resumen

La composición genética de la mayoría de las bacterias está codificada en un solo cromosoma, mientras que alrededor del 10% tienen más de un cromosoma. Entre éstas, Vibrio cholerae, con dos cromosomas, ha servido como sistema modelo para estudiar diversos aspectos del mantenimiento cromosómico, principalmente la replicación, y la partición fiel de genomas multipartitos. Aquí describimos la caracterización genómica de cepas que constituyen una excepción a las reglas de los dos cromosomas: el V. cholerae monocromosómico natural. Los análisis de la secuencia del genoma completo de NSCV1 y NSCV2 (vibrio monocromosómico natural) revelaron que las uniones de fusión Chr1 y Chr2 contienen profagos, elementos IS y repeticiones directas, además de reordenamientos cromosómicos a gran escala como inversiones, inserciones y repeticiones largas en tándem en otras partes del cromosoma, en comparación con los genomas prototípicos de dos cromosomas de V. cholerae. Muchos de los factores de virulencia conocidos del cólera están ausentes. Los dos orígenes de replicación y los genes asociados están generalmente intactos, con mutaciones sinónimas en algunos genes, al igual que recA y los genes de reparación de emparejamientos erróneos (MMR) dam, mutH y mutL; la función MutS está probablemente alterada en NSCV2. Estas cepas son herramientas ideales para estudiar los aspectos mecánicos del mantenimiento de cromosomas con múltiples orígenes y otros reordenamientos, así como la importancia biológica, funcional y evolutiva de la arquitectura genómica multipartita en general.

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Información del documento

  • Titulo:Exception to the Rule: Genomic Characterization of Naturally Occurring Unusual Vibrio cholerae Strains with a Single Chromosome
  • Autor:Gary, Xie; Shannon L., Johnson; Karen W., Davenport; Mathumathi, Rajavel; Torsten, Waldminghaus; John C., Detter; Patrick S., Chain; Shanmuga, Sozhamannan
  • Tipo:Artículo
  • Año:2017
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi
  • Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
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