En los últimos años, varias tecnologías para el análisis completo del transcriptoma y proteoma han alcanzado un nivel tecnológico que permite su aplicación rutinaria como herramientas científicas. El principio de estos métodos es la identificación y cuantificación de hasta diez mil especies de ARN y proteínas en un tejido, en contraste con el análisis secuencial de métodos convencionales como la PCR y la Western blot. Debido a su progreso técnico, los análisis del transcriptoma y proteoma están cobrando cada vez más relevancia en todos los campos de la investigación biológica. Se utilizan principalmente para la identificación exploratoria de patrones de expresión génica complejos asociados a enfermedades y, de esta manera, sientan las bases para estudios basados en hipótesis. Esta revisión ofrece una visión general de los métodos actualmente disponibles para el análisis del transcriptoma, es decir, microarrays, Ref-Seq, arrays de PCR cuantitativa y discute sus potenciales y limitaciones. En segundo lugar, se presentan los enfoques más poderosos actuales para el análisis
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