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Artículo

Exploring Heat-Response Mechanisms of MicroRNAs Based on Microarray Data of Rice Post-meiosis PanicleExploración de los Mecanismos de Respuesta al Calor de los MicroRNAs Basados en Datos de Microarrays de la Panícula Post-meiosis del Arroz

Resumen

Para explorar los mecanismos de respuesta al calor de los mircoARNs (miARNs) en la panícula post-meiosis del arroz, se realizó un análisis de microarrays de ARN aislado de panículas de arroz post-meiosis que fueron tratadas a 40°C durante 0 min, 10 min, 20 min, 60 min y 2 h. Mediante la integración de miARNs emparejados expresados diferencialmente (DE) y perfiles de expresión de ARNm, encontramos que los niveles de expresión de 29 familias DE-miARN estaban negativamente correlacionados con sus 178 genes diana DE. Otros análisis mostraron que la mayoría de los miRNAs en 29 familias DE-miRNA resistieron el estrés térmico mediante la regulación a la baja de sus genes diana y que existía un desfase temporal entre la expresión de los miRNAs y sus genes diana. A continuación, la clasificación GO-Slim y la identificación funcional de estos 178 genes diana mostraron que (1) los miARNs participaban principalmente en una serie de procesos biológicos básicos incluso en condiciones de calor; (2) algunos miARNs podrían desempeñar papeles importantes en la resistencia al calor (como osa-miR164, osa-miR166, osa-miR169, osa-miR319, osa-miR390, osa-miR395 y osa-miR399); (3) osa-miR172 podría desempeñar un papel importante en la protección de la panícula de arroz bajo estrés térmico, pero osa-miR437, osa-miR418, osa-miR164, miR156 y miR529 podrían afectar negativamente a la fertilidad del arroz y a la floración de la panícula; y (4) osa-miR414 podría inhibir la expresión génica de la floración mediante la regulación a la baja de LOC_Os 05g51830 para retrasar el encabezamiento del arroz. Por último, se construyó una red miRNA-PPI (interacción proteína-proteína) inducida por calor y se descubrieron tres módulos coreguladores miRNA.

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