Resumen

Anteriormente, para predecir regiones codificantes en secuencias de nucleótidos, se ha desarrollado un método de rotación espectral autoadaptativo (SASR), basado en una característica estadística universal de las regiones codificantes, llamada periodicidad de tripletes (TP). Produce un recorrido aleatorio, es decir, un recorrido TP, en el plano complejo para la secuencia de consulta. Cada paso en el recorrido corresponde a una posición en la secuencia y se genera a partir de una estadística a largo plazo de la TP en la secuencia. Las regiones codificantes (intensivas en TP) son entonces visualmente discriminadas de las que no codifican (sin TP), en el recorrido TP. En este artículo, se investigan cualitativamente los comportamientos de los recorridos para secuencias de nucleótidos aleatorias. Se observa una ligera tendencia hacia la izquierda (un ruido negativo) en tales recorridos, que no se ha reportado en la literatura previa de SASR. Se propone un SASR mejorado, llam

• Materias:Modelos matemáticos Conjuntos difusos Ecuaciones integrales Fusión de características Algoritmo de optimización
• Subjects:Mathematical models Fuzzy sets Integral equations Feature fusion Optimization algorithm
• Palabras claves:Regiones codificantes; Secuencias de nucleótidos; Rotación espectral; Periodicidad de tripletes; Método SASR; Caminata TP
• Keywords:Coding regions; Nucleotide sequences; Spectral rotation; Triplet periodicity; SASR method; TP walk