Resumen

Este estudio ha analizado los patrones de expresión génica de un conjunto de datos de microarrays de IPMN que incluye muestras de tejido ductal pancreático normal (NT), adenoma mucinoso papilar intraductal (IPMA), carcinoma mucinoso papilar intraductal (IPMC) y carcinoma ductal invasivo (IDC). Y se detectaron ocho grupos de genes expresados diferencialmente (DEG) con un patrón de expresión similar mediante agrupación de k-means. A continuación, se estableció un mapa de estudio del trastorno funcional en la progresión de IPMN mediante el análisis de enriquecimiento funcional de estos clusters. Además, se utilizó el análisis de enriquecimiento de factores de transcripción (TFs) para detectar los TFs clave en cada cluster de DEGs, y se encontró que tres TFs (FLI1, ERG, y ESR1) regulaban significativamente los DEGs en el cluster 1, y la expresión de estos tres TFs fue validada por qRT-PCR. Todos estos resultados indicaron que estos tres TFs podrían desempeñar papeles clave en las primeras etapas de la progresión de IPMN.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genética vegetal Genómica Proteómica Transcripción genética
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Plant genetics Genomics Proteomics Genetic transcription
• Palabras claves:TFs, DEGs, progresión IPMN, adenoma mucinoso papilar intraductal, carcinoma mucinoso papilar intraductal, tejido ductal pancreático normal, conjunto de datos de microarrays IPMN, análisis de enriquecimiento funcional, patrones de expresión génica, carcinoma ductal invasivo.
• Keywords:TFs, DEGs, IPMN progression, intraductal papillary mucinous adenoma, intraductal papillary mucinous carcinoma, normal pancreatic ductal tissue, IPMN microarray dataset, functional enrichment analysis, gene expression patterns, invasive ductal carcinoma