Resumen

P. fucata experimenta una serie de transformaciones en su apariencia, desde larvas nadadoras hasta juveniles sésiles, durante las cuales probablemente se producen cambios significativos en la expresión génica. Así pues, P. fucata podría ser un modelo ideal para estudiar los mecanismos moleculares de la metamorfosis larvaria durante el desarrollo en invertebrados. Para estudiar la fuerza molecular que impulsa el desarrollo metamórfico en larvas de P. fucata, se secuenciaron los transcriptomas de cinco estadios larvarios (trocóforo, forma-D, umbonal, eyespots y spats) utilizando un sistema Illumina HiSeq™ 2000 y se ensamblaron y caracterizaron con los transcritos de seis tejidos. Como resultado, se ensambló un total de 174.126 transcritos únicos y se anotaron 60.999. El número de unigenes varió entre los cinco estadios larvarios. Los perfiles de expresión eran claramente diferentes en las larvas trocófora, en forma de D, umbonal, ocular y de espátula. Como resultado, se clasificaron 29 tendencias de expresión, de las cuales ocho eran significativas. Entre otras, se identificaron 80 unigenes de expresión diferencial (DEG) relacionados con el desarrollo, la mayoría de los cuales eran genes homeobox. La mayoría de los DEG se encontraban en larvas trocóforas, en forma de D y UES (umbonal, eyespots y spats), según se verificó mediante qPCR. El análisis de componentes principales (ACP) también reveló diferencias significativas en la expresión entre larvas trocóforas, en forma de D y UES, con diez transcripciones identificadas pero sin anotaciones coincidentes.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:eyespots, larvas, spats, P. fucata, estadios larvarios, Illumina HiSeq™, análisis de componentes principales, fuerza motriz molecular, desarrollo, resultado.
• Keywords:eyespots, larvae, spats, P. fucata, larval stages, Illumina HiSeq™, Principal component analysis, molecular driving force, development, result