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A Sparse Feature Extraction Method with Elastic Net for Drug-Target Interaction IdentificationUn Método de Extracción de Características Escasas con Elastic Net para la Identificación de Interacciones Fármaco-Blanco

Resumen

La identificación de interacciones fármaco-objetivo (DTIs) juega un papel crucial en el descubrimiento de medicamentos. Sin embargo, las técnicas tradicionales de alto rendimiento basadas en ensayos clínicos son costosas, engorrosas y consumen mucho tiempo para identificar DTIs. Por lo tanto, se necesitan con urgencia nuevos métodos computacionales inteligentes para superar estas deficiencias en la predicción de DTIs. En este documento, proponemos un nuevo método computacional que combina la matriz de puntuación específica de posición (PSSM), la extracción de características dispersas basada en red elástica y el clasificador de bosque de rotación (RF). Específicamente, convertimos cada secuencia primaria de proteínas en PSSM, que contiene información evolutiva biológica. Luego extraemos los descriptores de características dispersas ocultas en PSSM mediante el método de extracción de características dispersas basado en red elástica (ESFE). Después, los fusionamos con las características del fármaco, que están representadas por huellas

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