Resumen

Empleamos una estrategia integradora para presentar hallazgos metabólicos y genómicos sustractivos y comparativos de dianas terapéuticas contra Streptococcus parauberis. Por primera vez, no sólo identificamos dianas potenciales basadas en análisis de bases de datos genómicas y proteómicas, sino que también recomendamos un nuevo fármaco antimicrobiano para el tratamiento de la platija olivácea (Paralichthys olivaceus) infectada por S. parauberis. Para ello, se extrajeron 102 rutas metabólicas anotadas de esta cepa bacteriana a partir de bases de datos metabólicas y genómicas comparativas. A partir de estas rutas metabólicas se identificaron seis proteínas susceptibles de fármacos en la base de datos DrugBank con sus respectivos genes como mtnN, penA, pbp2, murB, murA, coaA y fni de un total de 112 proteínas esenciales no homólogas. Entre estas coincidencias, se extrajeron 26 proteínas transmembrana y 77 proteínas citoplasmáticas como posibles vacunas y dianas farmacológicas, respectivamente. Del FDA DrugBank, se seleccionó el ceftiofur para prevenir la resistencia a los antibióticos, ya que inhibía nuestra diana identificada. El florfenicol se utiliza para el tratamiento de la infección por S. parauberis en la platija y se eligió como fármaco de comparación. Todas las cepas probadas de peces aislados con S. parauberis fueron susceptibles a ceftiofur y florfenicol con concentraciones inhibitorias mínimas (CIM) de 0,0039-1 μg/mL y 0,5-8 μg/mL, IC50 de 0,001-0,5 μg/mL y 0,7-2,7 μg/mL, y concentraciones mínimas de erradicación de biopelículas (MBEC) de 2-256 μg/mL y 4-64 μg/mL, respectivamente. Se encontraron perfiles de susceptibilidad similares para el ceftiofur y el florfenicol, observándose que el ceftiofur es un fármaco antimicrobiano eficaz y potente contra cepas tanto planctónicas como formadoras de biopelículas del patógeno de peces Streptococcus parauberis, y que puede aplicarse en la industria acuícola. Así pues, nuestro enfoque predictivo no sólo mostró nuevos agentes terapéuticos, sino que también indicó que los fármacos comercializados también deberían someterse a pruebas de eficacia contra las dianas recientemente identificadas de este importante patógeno de los peces.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genómica Inestabilidad genómica Polimorfismo genético
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Genomics Genomic instability Genetic polymorphism
• Palabras claves:ceftiofur, S. parauberis, vías metabólicas, patógeno de peces Streptococcus parauberis, concentraciones mínimas de erradicación de biopelículas, perfiles de susceptibilidad similares, metabólica comparativa computacional, proteínas esenciales no homólogas, importante patógeno de peces, concentraciones inhibitorias mínimas
• Keywords:ceftiofur, S. parauberis, metabolic pathways, fish pathogen Streptococcus parauberis, minimum biofilm eradication concentrations, Similar susceptibility profiles, computational comparative metabolic, essential nonhomologous proteins, important fish pathogen, minimum inhibitory concentrations