La resistencia de Plasmodium falciparum a la cloroquina (CQ) es una causa importante de mortalidad y morbilidad en todo el mundo. Hay pocos datos documentados sobre la prevalencia de haplotipos mutantes resistentes a la CQ de los genes Pfcrt y Pfmdr1 en las zonas tribales bajo administración federal de Pakistán, donde la malaria es endémica. El objetivo de este estudio era investigar la prevalencia de la resistencia a la CQ de P. falciparum en esta área. Se recogieron aislados clínicos entre mayo de 2017 y mayo de 2018 en las agencias de Waziristán del Norte y Waziristán del Sur del Área Tribal Administrada Federalmente. Posteriormente, se examinaron frotis de sangre teñidos con Giemsa para detectar Plasmodium falciparum. Se extrajo ADN malárico de las muestras de P. falciparum positivas al microscopio y se confirmaron las infecciones por P. falciparum mediante PCR anidada (dirigida a los genes de ácido ribonucleico ribosómico de subunidad pequeña (ssrRNA) de Plasmodium). Todas las muestras de P. falciparum confirmadas por PCR se secuenciaron por pirosecuenciación para averiguar la mutación en el gen Pfcrt en el codón K76T y en pfmdr1 en los codones N86Y, Y184F, N1042D y D1246Y. De 121 casos de P. falciparum positivos a microscopia, 109 muestras fueron positivas para P. falciparum mediante PCR anidada. La mutación Pfcrt K76T se encontró en el 96% de los aislados, la mutación Pfmdr1 N86Y se observó en el 20%, y el 11% albergaba la mutación Y184F. Todas las muestras eran de tipo salvaje para los codones N1042D y D1246Y de Pfmdr1. En las FATA (Pakistán), la frecuencia del alelo resistente 76T siguió siendo alta a pesar de la eliminación de la CQ. Sin embargo, los resultados actuales del estudio sugieren una fijación completa del genotipo resistente a la CQ de P. falciparum en la zona de estudio.
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