Resumen

Los biomarcadores de la osteoartritis (OA) que pueden diagnosticar con precisión la enfermedad en la fase más temprana apoyarían significativamente los esfuerzos para desarrollar tratamientos para la prevención y la intervención temprana. Hemos tratado de determinar el curso temporal de las alteraciones en el perfil de expresión génica de la sangre periférica asociadas al desarrollo de la OA. Se recogieron muestras de sangre de una vena de la cola de ratas individuales con OA inducida por yodoacetato monosódico (MIA) (2, 14, 21 y 28 días después del tratamiento). Se utilizaron microarrays de genoma completo para revelar alteraciones transcripcionales relacionadas con la OA en 72 transcritos. Tres grupos principales de genes coexpresados revelaron diversos perfiles dependientes del tiempo de regulación al alza y a la baja. Se indicaron vínculos funcionales que conectan la expresión de los genes gradualmente regulados a la baja con la vía de señalización G13. Los niveles de abundancia de ARNm de los transcritos identificados se analizaron más a fondo en un conjunto de datos de expresión génica de acceso público obtenidos de una cohorte de pacientes con OA del estudio GARP. Revelamos tres genes expresados diferencialmente tanto en sangre de rata como humana (TNK2, KCTD2 y WDR37). Las alteraciones en la expresión de los transcritos seleccionados en muestras de sangre periférica de los pacientes indican una heterogeneidad de los perfiles de OA potencialmente relacionada con el progreso de la enfermedad y la gravedad de los síntomas clínicos. Nuestro estudio identifica varios biomarcadores potenciales específicos de la etapa de progresión de la OA.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:transcritos, conjunto de datos de expresión génica disponible, perfil de expresión génica en sangre periférica, cohorte del estudio GARP, niveles de abundancia de ARNm, muestras de sangre periférica, varias etapas potenciales, alteraciones, expresión, genes
• Keywords:transcripts, available gene expression dataset, peripheral blood gene expression profile, GARP study cohort, mRNA abundance levels, peripheral blood samples, several potential stage, alterations, expression, genes