Los proteasomas están compuestos por partículas centrales 20S (CP) de subunidades de tipo α y β que se asocian con ATPasas AAA de partículas reguladoras como los complejos de nucleotidasa activadora de proteasomas (PAN) de las arqueas. En este estudio, se investigaron las funciones y los sitios adicionales de modificación postraduccional de los proteasomas utilizando la arquea Haloferax volcanii como modelo. Indicativo de la fosforilación, las isoformas sensibles a la fosfatasa de α1 y α2 fueron detectadas por inmunoblot 2-DE. Para mapear estos y otros posibles sitios de modificación postraduccional, se purificaron los proteasomas y se analizaron por espectrometría de masas en tándem (MS/MS). Utilizando este enfoque, se mapearon varios fosfositios incluyendo α1 Thr147, α2 Thr13/Ser14 y PAN-A Ser340. También se mapearon múltiples sitios de metilación en α1, revelando así un nuevo tipo de modificación proteasomal. El estudio del papel biológico de la fosforilación de α1 y PAN-A mediante mutagénesis dirigida al sitio reveló fenotipos negativos dominantes para la viabilidad celular y/o la pigmentación de las variantes de α1, incluyendo Thr147Ala, Thr158Ala y Ser58Ala. Se purificó un homólogo de la cinasa Ser/Thr de H. volcanii Rio1p y se demostró que cataliza la autofosforilación y la fosfotransferencia a α1. Las variantes de α1 en los residuos Thr y Ser que mostraron fenotipos dominantes negativos estaban significativamente reducidas en su capacidad de aceptar grupos fosforilo de Rio1p, proporcionando así un importante vínculo entre la fisiología celular y la fosforilación proteasomal.
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