Resumen

El diseño de cebadores y sondas para la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) es un paso preliminar y crítico que requiere la identificación de regiones altamente conservadas en un conjunto dado de secuencias. Esta tarea puede resultar complicada si las secuencias objetivo presentan un alto nivel de diversidad, como ocurre con frecuencia en los estudios microbiológicos. Hemos desarrollado Gemi, una herramienta bioinformática automatizada, rápida y fácil de usar con una interfaz sencilla para diseñar cebadores y sondas a partir de múltiples secuencias alineadas. Esta herramienta puede utilizarse tanto para la PCR en tiempo real como para la convencional y puede tratar eficazmente grandes conjuntos de secuencias de gran tamaño.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genes mitocondriales Genómica Proteómica Epigenómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Mitochondrial genes Genomics Proteomics Epigenomics
• Palabras claves:secuencias, reacción en cadena de la polimerasa, uso de herramienta bioinformática, cebadores, sondas, PCR convencional, paso crítico, interfaz amigable, alto nivel, grandes conjuntos
• Keywords:sequences, polymerase chain reaction, use bioinformatics tool, primers, probes, conventional PCR, critical step, friendly interface, high level, large sets