Resumen

Se construyó una biblioteca de ADN complementario a partir de las flores de Chimonanthus praecox, un arbusto ornamental perenne que florece en invierno en China. Se obtuvieron 867 secuencias de alta calidad con una longitud media de lectura de 673,8 pb. Una vez agrupadas y ensambladas las etiquetas de secuencia expresada, se identificó un conjunto no redundante de 479 unigenes, que incluía 94 contigs y 385 singletons. El análisis BLAST con la base de datos no redundante de proteínas y la base de datos no redundante de nucleótidos reveló que 405 unigenes compartían una homología significativa con genes conocidos. Los unigenes homólogos se clasificaron según las jerarquías de Gene Ontology (biológica, celular y molecular). Mediante análisis BLAST y anotación Gene Ontology, se identificaron 95 unigenes implicados en estrés y defensa y 19 unigenes relacionados con el desarrollo floral, basándose en los conocimientos existentes. Doce genes, de los cuales 9 se anotaron como "respuesta al frío", se examinaron mediante RT-PCR en tiempo real para comprender los cambios en los patrones de expresión bajo estrés por frío y validar los hallazgos. Catorce genes, incluidos 11 genes relacionados con el desarrollo floral, también se detectaron mediante RT-PCR en tiempo real para validar los patrones de expresión en el proceso de floración y en diferentes tejidos. Este estudio proporciona una base útil para el análisis genómico de C. praecox.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genes mitocondriales Genómica Proteómica Epigenómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Mitochondrial genes Genomics Proteomics Epigenomics
• Palabras claves:genes, unigenes, análisis BLAST, patrones de expresión, desarrollo floral, tiempo RT, floración de arbustos ornamentales perennes, anotación Gene Ontology, jerarquías Gene Ontology, longitud media de lectura
• Keywords:genes, unigenes, BLAST analysis, expression patterns, floral development, time RT, ornamental perennial shrub blossoming, Gene Ontology annotation, Gene Ontology hierarchies, average read length