Resumen

La ontología génica (GO) es un recurso para la anotación coherente de genes y productos génicos ampliamente utilizado por numerosos repositorios públicos de gran tamaño. La GO se compone de tres subontologías que describen el componente celular de acción, la función molecular y el proceso biológico general de un gen o producto génico. La consulta de las subontologías es problemática y no existe un método estándar para, por ejemplo, encontrar todas las funciones moleculares que se dan en un componente celular concreto. GOLink aborda este problema buscando términos de todas las subontologías que coincidan con un término de interés en la anotación de toda la base de datos GO. Los genes anotados con este término se exportan y su anotación GO se asigna a tres listas separadas de términos GOLink en función de criterios específicos. El software se utilizó para predecir el proceso biológico más probable de un grupo de genes utilizando sólo sus términos de función molecular, con una sensibilidad, especificidad y precisión de entre el 80 y el 90 %. en todas las listas de términos. GOLink está disponible gratuitamente para uso no comercial y puede descargarse del sitio web del proyecto.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genómica Polimorfismo genético Proteómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Genomics Genetic polymorphism Proteomics Computational biology
• Palabras claves:subontologías, numerosos repositorios públicos de gran tamaño, listas de términos GOLink separadas, términos de función molecular, base de datos GO completa, proceso biológico probable, proceso biológico global, componente celular concreto, GOLink, genes
• Keywords:subontologies, numerous large public repositories, separate GOLink terms lists, Molecular Function terms, entire GO database, likely Biological Process, overall biological process, particular cellular component, GOLink, genes