Resumen

Con la disponibilidad de una secuencia del genoma y de herramientas genéticas cada vez más sofisticadas, Haloferax volcanii se está convirtiendo en un modelo tanto para las arqueas como para los halófilos. Para que H. volcanii alcance un estatus equivalente al de Escherichia coli, Bacillus subtilis o Saccharomyces cerevisiae, es necesario construir una colección de genes knockout con el fin de identificar el conjunto de genes esenciales de las arqueas y permitir el cribado sistemático de fenotipos. Se implementó un protocolo racionalizado de deleción de genes adaptado para su potencial automatización y se utilizó para generar 22 cepas de deleción de H. volcanii e identificar varios genes potencialmente esenciales. Estos mutantes de deleción de genes, generados en este estudio y en otros anteriores, se analizaron a continuación con un alto rendimiento para medir las tasas de crecimiento en diferentes medios y condiciones de temperatura. Concluimos que estos métodos de alto rendimiento son adecuados para una investigación rápida de una biblioteca de mutantes de H. volcanii y sugerimos que deberían constituir la base de un experimento más amplio a nivel del genoma.

• Materias:Biología Metano Ácido desoxirribonucleico (ADN) Metabolismo Metabolismo (Bioquimica) Arqueas metanogénico
• Subjects:Biology Methane Deoxyribonucleic acid (DNA) Metabolism Metabolism (Biochemistry) Archeas methanogenic
• Palabras claves:herramientas genéticas sofisticadas, cepa de deleción volcanii, conjunto de genes esenciales, mutante de deleción de genes, criba sistemática de fenotipos, moda de rendimiento, experimento amplio, métodos de rendimiento, investigación rápida, biblioteca de mutantes
• Keywords:sophisticated genetic tools, volcanii deletion strain, essential gene set, gene deletion mutant, systematic phenotype screen, throughput fashion, wide experiment, throughput methods, rapid investigation, mutant library