Resumen

Las especies de patata que producen tubérculos poseen varios genes que pueden aprovecharse para mejorar el fondo genético de la patata cultivada Solanum tuberosum. Entre ellas, S. bulbocastanum y S. commersonii son bien conocidas por su gran resistencia al estrés ambiental. Sin embargo, se dispone de escasa información sobre estas especies en términos de organización del genoma, función génica y redes reguladoras. En consecuencia, las herramientas genómicas de ayuda a la mejora genética son escasas, y la explotación eficiente de estas especies ha sido limitada hasta la fecha. En este trabajo, empleamos las secuencias del genoma de referencia de la patata y el tomate cultivados y una colección de secuencias de 1.423 marcadores de la tecnología Diversity Arrays (DArT) de la patata que muestran una representación polimórfica en los genomas de los genotipos de S. bulbocastanum y/o S. commersonii. Nuestros resultados ponen de relieve la heterogeneidad a microescala de la secuencia genómica, que puede desempeñar un papel significativo en la divergencia funcional y estructural entre especies emparentadas. Nuestro enfoque analítico proporciona conocimientos sobre la variabilidad estructural y de secuencia del genoma que no podrían detectarse mediante enfoques basados en el transcriptoma y el proteoma.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genómica Polimorfismo genético Proteómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Genomics Genetic polymorphism Proteomics Computational biology
• Palabras claves:S. bulbocastanum, heterogeneidad de secuencias genómicas a microescala, Tecnología de Arrays de Diversidad de la patata, patata Solanum tuberosum, secuencias genómicas de referencia, especies, S. commersonii, enfoque analítico, genotipos commersonii, explotación eficiente.
• Keywords:S. bulbocastanum, microscale genome sequence heterogeneity, potato Diversity Arrays Technology, potato Solanum tuberosum, reference genome sequences, species, S. commersonii, analytical approach, commersonii genotypes, efficient exploitation