Resumen

La superóxido dismutasa (SOD) es una enzima esencial del sistema antioxidante de las plantas que responde al daño oxidativo causado por condiciones adversas. Sin embargo, se sabe poco sobre la familia de genes SOD en Vitis vinifera (Vv). En el presente estudio, se identificaron diez genes SOD, incluyendo 6 SODs de cobre/zinc, 2 SODs de hierro y 2 SODs de manganeso, en el genoma de la vid, donde estaban distribuidos de forma desigual en 12 cromosomas. Diez genes VvSOD se dividieron en tres grupos principales basándose en el análisis filogenético, la localización subcelular y la distribución de motivos proteicos conservados. Además, en los promotores de los 10 genes VvSOD se encontraron muchos elementos cis relacionados con diferentes estreses. El análisis sinténico reveló que VvMSD1 y VvMSD2 derivaban de una duplicación segmentaria, y VvCSD4 y VvCSD5 pertenecen a un par de genes duplicados en tándem. El análisis de expresión génica basado en datos de microarrays mostró que los 10 genes VvSOD se expresaban en todos los tejidos analizados. Curiosamente, el par de genes duplicados segmentariamente (VvMSD1 y VvMSD2) mostraba patrones de expresión diferenciales en varios órganos. Por el contrario, el par de genes duplicados en tándem (VvCSD4 y VvCSD5) mostraron patrones de expresión similares en los órganos analizados. Nuestros resultados proporcionan una base para futuras investigaciones funcionales sobre la familia de genes SOD en la vid.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:Familia de genes SOD, genes VvSOD, par de genes, análisis de expresión génica, motivos proteicos conservados, patrones de expresión diferencial, investigación funcional adicional, sistema antioxidante vegetal, patrones de expresión similares, VvCSD5
• Keywords:SOD gene family, VvSOD genes, gene pair, Gene expression analysis, conserved protein motifs, differential expression patterns, further functional research, plant antioxidant system, similar expression patterns, VvCSD5