Resumen

La robustez genética se refiere a un mecanismo compensatorio para amortiguar las mutaciones deletéreas o las variaciones ambientales. Se ha demostrado que la duplicación de genes proporciona este tipo de respaldo funcional. Sin embargo, la contribución global de la duplicación a la robustez genética es bastante pequeña. En este estudio, investigamos si la compensación transcripcional también existe entre genes que comparten funciones similares sin homología de secuencia. Se evaluó un conjunto de pares de genes sintéticos-letales no homólogos utilizando una red de coexpresión, interacciones proteína-proteína y otros tipos de interacciones genéticas en levadura. Nuestros resultados difieren notablemente de los de estudios anteriores sobre paralogismos amortiguadores. La baja similitud de expresión y la coexpresión condicional por sí solas no desempeñan ningún papel en la identificación de los genes funcionalmente compensadores. Propiedades adicionales como la interacción sintético-letal, la proporción de compañeros comunes de interacción y el grado de corregulación fueron, al menos en parte, necesarias para extraer genes compensadores funcionales. Nuestro enfoque basado en redes es aplicable para seleccionar varios casos bien documentados de pares de genes compensatorios y un conjunto de nuevos pares. Los resultados sugieren que la reprogramación transcripcional desempeña un papel limitado en la compensación funcional entre genes no homólogos. Nuestro estudio ayuda a comprender con más detalle el mecanismo y las características de la compensación funcional.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genes mitocondriales Genómica Proteómica Epigenómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Mitochondrial genes Genomics Proteomics Epigenomics
• Palabras claves:compensación funcional, pares de genes compensadores, genes compensadores funcionales, pares de genes letales, baja similitud de expresión, tales respaldos funcionales, resultados, conjunto, estudio, Propiedades adicionales
• Keywords:functional compensation, compensatory gene pairs, functional compensatory genes, lethal gene pairs, low expression similarity, such functional backups, results, set, study, Additional properties