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Identification of Prognostic Immune-Related Genes by Integrating mRNA Expression and Methylation in Lung AdenocarcinomaIdentificación de genes pronósticos relacionados con la inmunidad mediante la integración de la expresión del ARNm y la metilación en el adenocarcinoma de pulmón

Resumen

Antecedentes. Existen numerosas pruebas que demuestran que los genes relacionados con el sistema inmunitario (IRG) y las modificaciones epigenéticas desempeñan un papel importante en el proceso biológico del cáncer. El objetivo de este estudio es establecer nuevos marcadores pronósticos de IRG mediante la integración de la expresión de ARNm y la metilación en el adenocarcinoma de pulmón (LUAD). Métodos y resultados. Los datos del perfil transcriptómico y los datos de ARN-seq de LUAD con la correspondiente información clínica de 543 casos de LUAD se descargaron de la base de datos The Cancer Genome Atlas (TCGA), que se analizaron mediante regresión proporcional de Cox univariante y regresión proporcional de Cox multivariante para desarrollar una firma pronóstica independiente. Sobre la base de esta firma, pudimos dividir a los pacientes LUAD en los grupos de alto riesgo, riesgo medio y bajo riesgo. Otros análisis de supervivencia demostraron que los pacientes de alto riesgo tenían una supervivencia global (SG) significativamente más corta que los pacientes de bajo riesgo. La firma, que contiene 8 IRG (S100A16, FGF2, IGKV4-1, CX3CR1, INHA, ANGPTL4, TNFRSF11A y VIPR1), también fue validada por datos de la base de datos Gene Expression Omnibus (GEO). También realizamos análisis de los niveles de metilación de los IRG relevantes y sus sitios CpG. Mientras tanto, sus asociaciones con el pronóstico fueron examinados y validados por la base de datos GEO, revelando que los niveles de metilación de INHA, S100A16, el sitio CpG cg23851011, y el sitio CpG cg06552037 pueden ser utilizados como los reguladores potenciales para el tratamiento de LUAD. Conclusiones. En conjunto, INHA, S100A16, el sitio CpG cg23851011, y el sitio CpG cg06552037 son biomarcadores prometedores para el seguimiento de los resultados de LUAD.

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