Resumen

La sequía sigue siendo uno de los estreses ambientales más graves debido a la continua reducción de la humedad del suelo, lo que exige la mejora de los cultivos con características como la tolerancia a la sequía. El guar [Cyamopsis tetragonoloba (L.) Taub], un cultivo forrajero e industrial, es una planta no sedentaria. Sin embargo, la información sobre los cambios en el transcriptoma que ocurren bajo estrés por sequía en guar es muy limitada; por lo tanto, es necesario un análisis de la expresión génica en este contexto. Aquí, estudiamos los genes diferencialmente expresados (DEGs) en respuesta al estrés por sequía y sus rutas metabólicas. Se utilizó RNA-Seq mediante un algoritmo de maximización de expectativas para estimar la abundancia génica. Posteriormente, se utilizó un Análisis Empírico de Datos Digitales de Expresión Génica en el paquete R Bioconductor para identificar DEGs. Se utilizaron Blast2GO, InterProScan y la Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes para explorar la anotación funcional, el análisis de proteínas, enzimas y rutas metabólicas. Los factores de transcripción se identificaron utilizando la base de datos PlantTFDB. Nuestro estudio identificó 499 genes regulados al alza y 191 regulados a la baja en respuesta al estrés por sequía. De ellos, 32 genes regulados al alza y seis regulados a la baja se consideraron nuevos genes exclusivos de guar. Un total de 137 familias de proteínas, 306 dominios, 12 repeticiones y dos sitios fueron regulados al alza. La familia del transportador de oligopéptidos dependiente de protones y la transferasa, el transportador de acuaporina, la proteína cinasa dependiente de calcio/calmodulina/dependiente de calcio, la familia de la peptidasa aspártica A1, la UDP-glucuronosil/UDP-glucosiltransferasa y la proteína intrínseca mayor fueron las familias de proteínas más reguladas. Los unigenes regulados al alza se asociaron con 88 enzimas y 77 vías KEGG. Por último, las familias de factores de transcripción MYB-related, MYB y ERF fueron las más reguladas. Estos datos pueden ser útiles para comprender la respuesta molecular de las plantas al estrés por sequía.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genómica Inestabilidad genómica Polimorfismo genético
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Genomics Genomic instability Genetic polymorphism
• Palabras claves:estrés por sequía, genes, rutas metabólicas, Datos Digitales de Expresión Génica, familias de factores de transcripción ERF, familia de peptidasas aspárticas A1, familia de transportadores de oligopéptidos dependientes, paquete R Bioconductor, proteína cinasa dependiente, análisis de expresión génica.
• Keywords:drought stress, genes, metabolic pathways, Digital Gene Expression Data, ERF transcription factor families, aspartic peptidase A1 family, dependent oligopeptide transporter family, R Bioconductor package, dependent protein kinase, gene expression analysis