Resumen

Scylla paramamosain es una especie de importancia comercial distribuida a lo largo de la costa del sur de China y otros países del Indo-Pacífico. Un descenso repentino de la salinidad que supere la capacidad de adaptación de S. paramamosain puede provocar daños o incluso la muerte. En nuestro estudio anterior, habíamos analizado el mecanismo de adaptación a la caída repentina de la salinidad desde el nivel de la transcriptómica y la proteómica, respectivamente. Este estudio realizó un análisis de correlación de la transcriptómica de secuenciación de ARN y la proteómica iTRAQ para investigar los mecanismos de adaptación a la caída repentina de la salinidad del 23‰ al 3‰. Hubo 3954 correlaciones y un total de 15 correlaciones para proteínas expresadas diferencialmente (DEPs) y genes expresados diferencialmente (DEGs) de proteómica y transcriptómica. La correlación entre DEPs y DEGs fue 0, y el coeficiente de correlación de Spearman de la correlación de la misma tendencia para DEPs y DEGs fue el más alto, alcanzando 0,9080. La correlación de enriquecimiento de vías KEGG reveló que la digestión y absorción de proteínas (Ko04974), el bicarbonato del túbulo proximal (Ko04964) y la secreción biliar (Ko04976) desempeñaban papeles importantes en el intercambio Na /H y Na /K. Además, genes importantes relacionados con la osmorregulación, como el transporte de iones y la anhidrasa carbónica, también se detectaron en el análisis de correlación para la misma tendencia DEPs_DEGs. En conclusión, los resultados de la correlación proteoma y transcriptoma de este estudio indican que el transporte de iones juega un papel crítico en la adaptación de S. paramamosain a la reducción repentina de la salinidad.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:DEGs, DEPs, transcriptómica, S. paramamosain, análisis de correlación, transporte de iones, correlación de enriquecimiento de vías KEGG, coeficiente de correlación de Spearman, descenso repentino de salinidad, bicarbonato del túbulo proximal.
• Keywords:DEGs, DEPs, transcriptomics, S. paramamosain, correlation analysis, ion transport, KEGG pathway enrichment correlation, Spearman correlation coefficient, Sudden salinity drop, proximal tubule bicarbonate