Resumen

En los últimos años, cada vez hay más pruebas de que la alteración del ARN circular (circARN) está estrechamente relacionada con la tumorigénesis y la progresión del cáncer. Sin embargo, las funciones reguladoras de la mayoría de los circRNAs en el cáncer de vejiga (BCa) siguen sin estar claras. El objetivo de este estudio era explorar el mecanismo de regulación molecular de los circRNAs en el BCa. Obtuvimos cuatro conjuntos de datos de perfiles de expresión de circRNAs, microRNAs (miRNAs) y mensajeros (mRNAs) de las bases de datos de microarrays Gene Expression Omnibus y The Cancer Genome Atlas e identificamos 434, 367 y 4799/4841 circRNAs, miRNAs y mRNAs expresados diferencialmente, respectivamente. Con estos ARN expresados diferencialmente, establecimos una red de interacción dirigida circARN-miARN-ARNm. Se identificaron un total de 18, 24 y 51 circRNAs, miRNAs y mRNAs centrales, respectivamente. Entre ellos, los 10 principales mRNAs que tenían una alta conectividad con otros circRNAs y miRNAs fueron considerados como genes centrales. Detectamos los niveles de expresión de estos 10 ARNm en 16 pares de tejidos de BCa y tejidos normales adyacentes mediante la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real. Los ARNm diferencialmente expresados y los ARNm centrales estaban enriquecidos en los procesos y vías que están asociados con el crecimiento, la diferenciación, la proliferación y la apoptosis de las células tumorales. Los genes destacados (CDCA4, GATA6, LATS2, RHOB, ZBTB4 y ZFPM2) también interactuaron con numerosos fármacos, lo que indica su potencia como biomarcadores y dianas farmacológicas. Los hallazgos de este estudio proporcionan un profundo conocimiento del mecanismo regulador de ARN endógeno competitivo relacionado con el circARN en la patogénesis del BCa.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genoma Genética vegetal Proteómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis genome Plant genetics Proteomics
• Palabras claves:ARNm, miARN, bases de datos de microarrays del Atlas del Genoma del Cáncer, reacción en cadena de la polimerasa en el tiempo, Gene Expression Omnibus, tejidos normales adyacentes, ARN endógeno competitivo, mecanismo de regulación molecular, BCa, circARN
• Keywords:mRNAs, miRNAs, Cancer Genome Atlas microarray databases, time polymerase chain reaction, Gene Expression Omnibus, adjacent normal tissues, competitive endogenous RNA, molecular regulatory mechanism, BCa, circRNAs