Los roedores causan graves efectos adversos en la producción de las explotaciones debido a la destrucción de alimentos, la contaminación de piensos y la circulación de enfermedades. La magnitud de los daños o de las enfermedades propagadas dependerá del tipo de roedores que invadan la granja. Este estudio se llevó a cabo con el fin de averiguar las especies de roedores que infestan las granjas avícolas de los alrededores de Mafikeng, provincia del Noroeste de Sudáfrica. El estudio formaba parte de un proyecto más amplio que investigaba los vectores de Salmonella en las granjas avícolas de la provincia. En el estudio se atraparon 154 roedores de las granjas seleccionadas y se utilizaron los genes de código de barras de la subunidad 1 de la citocromo oxidasa (COI) y del citocromo b (Cyt-b) para identificar las especies. Se identificaron dos especies de roedores plaga, a saber, Rattus rattus (la rata negra) y Rattus tanezumi (la rata asiática/rata doméstica asiática). Un total de 99 (64,3%) se identificaron como Rattus rattus y 55 (35,7%) como Rattus tanezumi. Entre los dos genes diana, el gen Cyt-b sólo fue capaz de identificar 40 (25,97%) del total de muestras, mientras que el COI fue más eficiente y amplificó todas las muestras, por lo que fue un gen diana mejor para este tipo de identificación. Las dos especies de ratas identificadas son vectores conocidos de enfermedades graves, por lo que su presencia debe considerarse un indicio de alto riesgo de enfermedades. Pese a haberse detectado antes en el país, el hallazgo de R. tanezumi como segunda especie de rata en la zona fue inesperado, ya que se sabe que esta especie es autóctona de Asia.
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