Resumen

La proteína de replicación A (RPA), un actor clave en el metabolismo del ADN, tiene 6 dominios de unión a ADN monocatenario (ssADN) A-F. Los experimentos SELEX con los DBDs-C, -D y -E recuperan una secuencia formadora de cuadruplex G de 20 nt. Los estudios de unión muestran que el RPA-DE se une preferentemente al ADN G-cuadruplex, una preferencia única no observada con otras construcciones de RPA. Los experimentos de dicroísmo circular muestran que el núcleo RPA-CDE puede desplegar el cuadruplex G mientras que el RPA-DE lo estabiliza. Los estudios de unión muestran que RPA-C se une de forma similar a secuencias ricas en pirimidina y purina. Esta diferencia entre la unión de RPA-C y RPA-DE también se puso de manifiesto por la incapacidad de RPA-CDE-core para desplegar un oligonucleótido que contenía una región TC 5′ al cuadruplex G. Los estudios de modelado molecular de la RPA-DE y las proteínas de unión a telómeros Pot1 y Stn1 revelan similitudes estructurales entre las proteínas e iluminan posibles sitios de unión al ADN para la RPA-DE y Stn1. Estos datos indican que los DBDs de RPA tienen diferentes propiedades de reconocimiento del ssADN.

• Materias:Ingeniería genética Ácido desoxirribonucleico (ADN) Ácido ribonucleico (ARN) Pliegue de Proteína Genómica
• Subjects:Genetic engineering Deoxyribonucleic acid (DNA) Ribonucleic acid (RNA) Protein Folding Genomics
• Palabras claves:rpa, dbds, cuadruplex, diferentes propiedades de reconocimiento del ssdna, experimentos de dicroísmo circular, experimentos de f. selex, estudios de modelización molecular, proteína de replicación a, cde, core
• Keywords:rpa, dbds, quadruplex, different ssdna recognition properties, circular dichroism experiments, f. selex experiments, molecular modeling studies, replication protein a, cde, core