Resumen

Se sabe que los factores de respuesta a la auxina (ARF) desempeñan funciones vitales durante el crecimiento y el desarrollo de las plantas. Con el fin de revelar funciones específicas relacionadas con los órganos vegetativos de las gramíneas, se llevó a cabo un estudio en profundidad de la familia de genes ARF en el pasto varilla (Panicum virgatum L.), una gramínea perenne C4 de estación cálida que se utiliza principalmente como bioenergía y materia prima animal. En el genoma de la switchgrass (2n = 4x = 36) se identificaron un total de 47 genes putativos de ARF (PvARF), 42 de los cuales estaban anclados a los siete pares de cromosomas y distribuidos de forma desigual. Se predijo que 16 PvARF eran objetivos potenciales de pequeños ARN (microARN160 y 167). Desde el punto de vista filogenético, los PvARF se dividieron en siete subgrupos distintos basados en la filogenia, la disposición exón/intrón y la distribución de motivos conservados. Además, 15 pares de PvARFs tienen diferentes perfiles de expresión temporal-espacial en órganos vegetativos (2º, 3º y 4º entrenudo y hojas), lo que implica que diferentes PvARFs tienen funciones específicas en el crecimiento y desarrollo del pasto varilla. Además, al menos 14 pares de PvARFs responden al tratamiento con ácido naftilacético (NAA), lo que podría sernos útil para estudiar la respuesta a la auxina en switchgrass. El análisis exhaustivo aquí descrito facilitará el futuro análisis funcional de los genes ARF en gramíneas.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Biogénesis Genética vegetal Genómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Biogenesis Plant genetics Genomics
• Palabras claves:PvARFs, pares, funciones específicas, órganos vegetativos, familia de genes ARF, factores de respuesta a auxina, Panicum virgatum L., distribución de motivos conservados, futuros análisis funcionales, genes putativos ARF
• Keywords:PvARFs, pairs, specific functions, vegetative organs, ARF gene family, Auxin response factors, Panicum virgatum L., conserved motif distribution, future functional analysis, putative ARF genes