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Artículo

Identifying the Risky SNP of Osteoporosis with ID3-PEP Decision Tree AlgorithmIdentificación del SNP de riesgo de osteoporosis con el algoritmo de árbol de decisión ID3-PEP.

Resumen

En los últimos 20 años, se ha avanzado mucho en el análisis genético de la osteoporosis. Se han encontrado varios genes y SNPs asociados con la osteoporosis a través del método GWAS. En este documento, pretendemos identificar los SNPs sospechosos de riesgo de osteoporosis con métodos computacionales basados en los SNPs asociados a la osteoporosis conocidos por GWAS. El proceso incluye dos pasos. En primer lugar, decidimos si los genes asociados con los SNPs sospechosos de riesgo están relacionados con la osteoporosis utilizando el algoritmo de caminata aleatoria en la red PPI de genes asociados a la osteoporosis por GWAS y los genes asociados con los SNPs sospechosos de riesgo. Para resolver el problema de sobreajuste en el algoritmo del árbol de decisión ID3, luego clasificamos los SNPs con resultados positivos en función de sus características de posición y función a través de un árbol de decisión de clasificación simplificado que fue construido por el algoritmo del árbol de decisión ID3 con PEP (P

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