Resumen

Se sabe que los genes bZIP (Basic leucine zipper) desempeñan un papel crucial en la respuesta a diversos procesos en las plantas, así como en situaciones de estrés abiótico o biótico. Hemos realizado una identificación y caracterización de 50 genes bZIP en el genoma de la fresa de bosque (Fragaria vesca), que se dividieron en 10 clados según la relación filogenética de las proteínas bZIP de fresa con las de Arabidopsis y arroz. Se observaron cinco categorías de patrones de intrones dentro de las regiones básicas y bisagra de los dominios bZIP. Se han encontrado algunos motivos conservados adicionales con la especificidad de grupo. Además, se predijo la especificidad de unión al ADN de las regiones básicas y bisagra, así como las propiedades de dimerización de las regiones de cremallera de leucina, lo que fue coherente con nuestro clado filogenético y se clasificó en 20 subfamilias. A través de las diferentes etapas de desarrollo de 15 órganos y dos tipos de frutos, los miembros del clado A bZIP mostraron diferentes patrones de expresión específicos de tejido y los genes duplicados fueron regulados diferencialmente, lo que indica una diversificación funcional junto con la expansión de esta familia de genes en la fresa. En condiciones normales de crecimiento, mrna11837 y mrna30280 del clado A mostraron niveles de expresión muy débiles en órganos y frutos, respectivamente; pero se observó una mayor expresión con diferentes conjuntos de genes tras los tratamientos de sequía y calor, lo que puede deberse a la vía de respuesta separada entre los tratamientos de sequía y calor.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:genes, regiones bisagra, cremallera de leucina básica, motivos conservados adicionales, desafíos de estrés biótico, diferentes etapas de desarrollo, regiones de cremallera de leucina, condiciones normales de crecimiento, vía de respuesta separada, patrones de expresión específicos
• Keywords:genes, hinge regions, Basic leucine zipper, additional conserved motifs, biotic stress challenges, different developmental stages, leucine zipper regions, normal growth conditions, separate response pathway, specific expression patterns