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In Silico Identification, Phylogenetic and Bioinformatic Analysis of Argonaute Genes in PlantsIdentificación in silico, análisis filogenético y bioinformático de genes argonautas en plantas

Resumen

La familia de proteínas argonautas son los actores clave en las vías de silenciamiento génico y los ARN pequeños reguladores en diferentes organismos. Las proteínas argonautas pueden unirse a pequeños ARN no codificantes y controlar la síntesis de proteínas, afectar a la estabilidad de los ARN mensajeros e incluso participar en la producción de nuevas formas de pequeños ARN. El objetivo de este estudio fue caracterizar y realizar un análisis bioinformático de las proteínas Argonautas en 32 especies vegetales de las que se secuenció su genoma. Se identificaron un total de 437 genes Argonauta y se analizaron en función de su longitud, estructura génica y estructura proteica. Los resultados mostraron que las proteínas argonautas estaban muy conservadas en todo el reino vegetal. El análisis filogénico dividió las Argonautas vegetales en tres clases. Las proteínas Argonautas tienen tres dominios conservados PAZ, MID y PIWI. Además de los tres dominios conservados, a saber, PAZ, MID y PIWI, identificamos algunos dominios más en AGO de algunas especies vegetales. El análisis del perfil de expresión de las proteínas argonautas mostró que la expresión de estos genes varía en la mayoría de los tejidos, lo que significa que estas proteínas están implicadas en la regulación de la mayoría de las vías del sistema vegetal. El número de transcritos alternativos de los genes Argonauta fue muy variable entre las plantas. Un análisis exhaustivo de un gran número de genes putativos de Argonauta reveló varios aspectos interesantes asociados a esta proteína y aportó información novedosa con una utilidad prometedora tanto para aplicaciones básicas como biotecnológicas.

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